国家蛋白质科学中心•上海（筹）位于上海市张江高科技园区海科路333号，总建筑面积约为33391平方米。2008年11月，国家发改委批复“蛋白质科学研究（上海）设施国家重大科技基础设施项目建议书”，蛋白质中心在设施建设启动时同步组织筹建，旨在提高我国以蛋白质结构研究为核心的蛋白质科学综合研究水平，集聚培养蛋白质研究高级科技人才，在国际前沿领域产出高水平的研究成果，建成国际一流的蛋白质科学研究中心，成为我国蛋白质科学技术的重要创新基地。